Στη Μήλο, στο Βόρειο τμήμα του νησιού, βρίσκεται η προϊστορική πόλη-οικισμός Φυλακωπή.
Η Φυλακωπή είναι ένα από τα σημαντικότερα δείγματα οικισμού της προϊστορικής και κυκλαδικής περιόδου στο Αιγαίο. Δημιουργήθηκε περί το 3000 π.Χ. και σταδιακά απέκτησε ρυμοτομικό σχέδιο, σπίτια και τείχη για την απόκρουση των εισβολέων. Η ανάπτυξη του εμπορίου με διάφορες περιοχές της Ελλάδας (βασικότερη η Κρήτη)έφερε σημαντική δύναμη στη Φυλακωπή που θα ζήσει σε μεγάλη ακμή μέχρι και το 1100 π.Χ. όταν και θα εγκαταλειφθεί και τα ηνία στη Μήλο θα αναλάβει η αρχαία πόλη Κλήμα.
Σήμερα στη Φυλακωπή μπορείτε να δείτε τα ερείπια του μεγάλου τείχους, των σπιτιών και των άλλων κτισμάτων του οικισμού, ενώ τα κινητά ευρήματα εκτίθενται στο Αρχαιολογικό Μουσείο Μήλου.
Κάνοντας διακοπές στη Μήλο, αξίζει να περάσετε και από τη Φυλακωπή.