Πάνω από το Παλιό Λιμάνι, στον κάβο του Φαναριού βρίσκεται η εκκλησία της Παναγίας Αρμάτας.  Χτίστηκε από τον Ιωάννη Κούτση προς τιμήν της Παναγίας σε ανάμνηση της μεγάλης νίκης των Σπετσών επί του Τουρκικού στόλου το 1822, νίκη που εορτάζεται ως και σήμερα κάθε Σεπτέμβριο (η γνωστή γιορτή της Αρμάτας).  Η εκκλησία χτίσθηκε σε σημείο που κατά τη διάρκεια της επαναστάσεως βρίσκονταν κανόνια που υπεράσπιζαν τις Σπέτσες, ενώ στον περίβολό της τοποθετήθηκε άγαλμα του πυρπολητή της Αρμάτας Κοσμά Μπαρμπάτση (έργο της διάσημης γλύπτριας Ναταλίας Μελά).