Στην Ηρακλειά βρίσκεται το σπήλαιο του Αγίου Ιωάννη( Άη Γιάννη).

Το σπήλαιο του Αγίου Ιωάννη είναι ένα από τα μεγαλύτερα αν όχι το μεγαλύτερο στις Κυκλάδες. Σύμφωνα με την παράδοση, ένας βοσκός που μπήκε στο σπήλαιο αναζητώντας καταφύγιο ανακάλυψε σε αυτό κρυμμένη την εικόνα του Αγίου Ιωάννη του Πρόδρομου. Έτσι πήρε το όνομά του το σπήλαιο, ενώ κάθε 28 Αυγούστου πραγματοποιείται στον πρώτο θάλαμο λειτουργία στη χάρη του Αγίου, με την εικόνα να ανηφορίζει για το σπήλαιο επικεφαλής πομπής από την Παναγιά.

Από σπηλαιολογικής απόψεως, το σπήλαιο του Αγίου Ιωάννη είναι απλά εντυπωσιακό. Μαγευτικοί σταλακτίτες και σταλαγμίτες συνθέτουν ένα μαγευτικό σκηνικό που αφήνει άφωνους τους επισκέπτες. Αν είστε τυχεροί μπορεί σε κάποια σημεία να διακρίνετε το περίφημο «σπηλαιόγαλα», μια σπάνια ρευστή σταλαγμιτική ύλη. Το σπήλαιο του Αγίου Ιωάννη ακολουθεί την γενικότερη λογική που διέπει την Ηρακλειά, γι αυτό μην περιμένετε φωτισμούς, σκάλες και λοιπές ανέσεις.

Για να φτάσετε στο σπήλαιο του Αγίου Ιωάννη θα χρειαστεί να περπατήσετε περίπου μια ώρα (ανάλογα και με τις δυνάμεις σας) ξεκινώντας από την Παναγιά. Η διαδρομή και η θέα είναι μαγευτικές και ίσως σας καθυστερήσουν λίγο, καθώς σίγουρα θα θελήσετε να αγναντέψετε και να βγάλετε φωτογραφίες. Λίγο πριν φτάσετε στο σπήλαιο του Αγίου Ιωάννη, θα συναντήσετε μια μικρότερη σπηλιά, που οι ντόπιοι την αποκαλούν «σπηλιά του Πολύφημου» από τον διάσημο Κύκλωπα της Οδύσσειας, χωρίς όμως να υπάρχουν στοιχεία που να δικαιολογούν κάτι τέτοιο. Όπως και να έχει, αξίζει όταν βρεθείτε στην Ηρακλειά να επισκεφθείτε τις σπηλιές της και να απολαύσετε από κοντά την ομορφιά τους.