Στη Μύκονο μπορείτε να φτάσετε με απευθείας πτήση από το Αεροδρόμιο Αθηνών «Ελευθέριος Βενιζέλος», από το οποίο υπάρχουν καθημερινά δρομολόγια. Ακόμα προς τη Μύκονο πραγματοποιούνται πολλές πτήσεις  τσάρτερ.

Το αεροδρόμιο της Μυκόνου απέχει 3 χιλιόμετρα από τη Χώρα και διαθέτει πιάτσα ταξί, στάση λεωφορείου καθώς και δυνατότητα για ενοικίαση αυτοκινήτων.